Búsqueda de Genomas
Genome Browser Sitio de la Universidad de San Francisco en California. Contiene secuencias de referencia y ensamblajes de una gran colección de genomas, incluido el de Bos Taurus.
Ensemble El proyecto Ensemble tiene bases de datos de genomas de vertebrados y otras especies, con información disponible en línea, así como diversas herramientas de análisis.
The Bovine Genome Database Página creada por el Bovine Genome Consortium con la finalidad de integrar una base de datos genómicos. Contiene anotaciones estructurales de los genes y genomas.
Livestock Genomics Sitio creado con el objetivo de facilitar el acceso a datos genómicos. Incluye información de SNPs de bovinos y ovejas, así como ligas a sitios relacionados.
Bovine Genome Browser Base de datos especializada en el genoma bovino, desarrollada y mantenida por el Bovine Genome Consortium.
Bovine Genome Assembly (v4.0) Buscador de genes o regiones del genoma bovino, soportado por Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO).
Mapas Genómicos
The cattle Bacterial Artificial Chromosome (BAC) library Buscador de secuencias bovinas generadas por medio de librerías en cromosomas artificiales BAC.
AgBase Página de la Universidad de Mississippi. Con herramientas de análisis funcionales, incluyendo estudios de ontología de genes.
ArkDB Base de datos genómica de animales de granja y otras especies. Contiene mapas de equilibrio de ligamiento, mapas físicos y de radiación híbridos, así como mapas de QTLs.
Búsqueda de SNPs
IBISS The Interactive Bovine in Silico SNP Base de datos desarrollada por la Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO). Permite el análisis in silico de SNPs. Contiene ESTs que son del dominio público, así como una base de datos de RNAs bovinos modelo.
Mapas de QTLs
CGD Cattle Genome DataBase Base de datos del genoma bovino. Contiene mapas de desequilibrio de ligamiento, cromosomas, información de loci, datos de contacto de investigadores, citas e información comparativa.
Bovine Tissues and DNA Inventory Database HapMap Project Base de datos con mapas de SNPs, MAF y de desequilibrio de ligamiento. Incluye datos de 30 razas bovinas.
Combined QTL Map of Dairy Cattle Traits En esta base se incluyen datos parciales y completos del genoma bovino, así como de cromosomas que han sido reportados y publicados en revistas o congresos. Los rasgos que se incluyen son recuento de células somáticas (SCS), Falta: producción y composición de la leche.
Bovine QTL Viewer Este sitio contiene todos los QTL públicamente disponibles para ganado lechero y cárnico.
Cattle QTLdb Contiene todos los QTL curados y sus asociaciones, provenientes de los datos de acceso público. Permite comparar, confirmar y localizar, en los cromosomas la región más probable de genes responsables de QTLs específicos.
Computational Biology and Functional Genomics laboratory En esta página se integran datos de proyectos de secuenciación y de ESTs de Bos Taurus. Busca representar de manera no redundante todos los genes de la especie, con datos de patrones de expresión, roles celulares y relaciones evolutivas y funcionales.
Búsqueda de Oligonucleótidos
BovineOligo Base de datos que contiene 16,846 secuencias de oligonucleótidos, así como anotaciones de ontología de genes (GO), para cada secuencia.
Computational Evolutionary Genomics Contiene predicciones de precursores de miRNA.